MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Natrialba magadii ATCC 43099 plasmid pNMAG01

Total Repeats: 9085

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013923	TCT	2	6	50	55	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_013923	CT	3	6	115	120	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3	NC_013923	ACT	2	6	204	209	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289583312
4	NC_013923	CACC	2	8	277	284	25 %	0 %	0 %	75 %	289583312
5	NC_013923	GT	5	10	317	326	0 %	50 %	50 %	0 %	289583312
6	NC_013923	CTTCG	2	10	353	362	0 %	40 %	20 %	40 %	289583312
7	NC_013923	ACT	2	6	382	387	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289583312
8	NC_013923	TGA	2	6	426	431	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289583312
9	NC_013923	AC	3	6	447	452	50 %	0 %	0 %	50 %	289583312
10	NC_013923	TGG	2	6	506	511	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	289583312
11	NC_013923	GAT	2	6	533	538	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NC_013923	CGA	2	6	577	582	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289583313
13	NC_013923	GGA	2	6	595	600	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	289583313
14	NC_013923	CTC	2	6	623	628	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	289583313
15	NC_013923	TCG	2	6	660	665	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289583313
16	NC_013923	ACTGGC	2	12	755	766	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	289583313
17	NC_013923	TG	3	6	774	779	0 %	50 %	50 %	0 %	289583313
18	NC_013923	TCG	2	6	801	806	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289583313
19	NC_013923	CGA	2	6	913	918	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289583313
20	NC_013923	TAC	2	6	962	967	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289583313
21	NC_013923	CAA	2	6	988	993	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	289583313
22	NC_013923	ACG	2	6	999	1004	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289583313
23	NC_013923	TCA	2	6	1011	1016	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289583313
24	NC_013923	CGA	2	6	1021	1026	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289583313
25	NC_013923	CCG	2	6	1199	1204	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289583313
26	NC_013923	CAT	2	6	1228	1233	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289583313
27	NC_013923	GAG	2	6	1397	1402	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	289583313
28	NC_013923	TC	3	6	1504	1509	0 %	50 %	0 %	50 %	289583313
29	NC_013923	ACG	2	6	1557	1562	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289583313
30	NC_013923	ACG	2	6	1571	1576	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289583313
31	NC_013923	GTC	2	6	1605	1610	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289583313
32	NC_013923	TCG	2	6	1636	1641	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289583313
33	NC_013923	GCG	2	6	1701	1706	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289583313
34	NC_013923	GGAA	2	8	1714	1721	50 %	0 %	50 %	0 %	289583313
35	NC_013923	TGGC	2	8	1807	1814	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
36	NC_013923	GATC	2	8	1868	1875	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
37	NC_013923	GAC	2	6	1923	1928	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_013923	CAC	2	6	2159	2164	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
39	NC_013923	GCGA	2	8	2254	2261	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
40	NC_013923	AGT	2	6	2289	2294	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_013923	GTATGA	2	12	2338	2349	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42	NC_013923	GAG	2	6	2427	2432	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
43	NC_013923	TTCG	2	8	2569	2576	0 %	50 %	25 %	25 %	289583314
44	NC_013923	ACG	2	6	2618	2623	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289583314
45	NC_013923	GCCA	2	8	2659	2666	25 %	0 %	25 %	50 %	289583314
46	NC_013923	TCG	2	6	2699	2704	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289583314
47	NC_013923	CTG	3	9	2742	2750	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289583314
48	NC_013923	TGG	2	6	2761	2766	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	289583314
49	NC_013923	GTT	2	6	2780	2785	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50	NC_013923	AC	3	6	2900	2905	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
51	NC_013923	TAC	2	6	2944	2949	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289583315
52	NC_013923	CGA	2	6	2954	2959	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289583315
53	NC_013923	AGC	2	6	2983	2988	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289583315
54	NC_013923	GTT	2	6	2997	3002	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	289583315
55	NC_013923	AAC	2	6	3010	3015	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	289583315
56	NC_013923	GA	3	6	3062	3067	50 %	0 %	50 %	0 %	289583315
57	NC_013923	CTG	2	6	3107	3112	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289583315
58	NC_013923	GAA	2	6	3144	3149	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289583315
59	NC_013923	GCG	2	6	3205	3210	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289583315
60	NC_013923	GAAA	2	8	3232	3239	75 %	0 %	25 %	0 %	289583315
61	NC_013923	GCC	2	6	3324	3329	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
62	NC_013923	TTC	2	6	3367	3372	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_013923	CT	3	6	3378	3383	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
64	NC_013923	TTC	2	6	3394	3399	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_013923	TATT	2	8	3571	3578	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_013923	TGTA	2	8	3600	3607	25 %	50 %	25 %	0 %	289583316
67	NC_013923	CCT	2	6	3632	3637	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	289583316
68	NC_013923	GAA	2	6	3657	3662	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289583316
69	NC_013923	ACT	2	6	3697	3702	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289583316
70	NC_013923	CCA	2	6	3716	3721	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	289583316
71	NC_013923	TCG	2	6	3751	3756	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289583316
72	NC_013923	CGAA	2	8	3792	3799	50 %	0 %	25 %	25 %	289583316
73	NC_013923	CGC	2	6	3816	3821	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289583316
74	NC_013923	GAG	2	6	3855	3860	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	289583316
75	NC_013923	AGA	2	6	3935	3940	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
76	NC_013923	CT	3	6	3948	3953	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
77	NC_013923	CGC	2	6	3988	3993	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
78	NC_013923	AGTT	2	8	4026	4033	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
79	NC_013923	TGC	2	6	4083	4088	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_013923	CG	3	6	4090	4095	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
81	NC_013923	TC	3	6	4102	4107	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
82	NC_013923	CACGAC	3	18	4124	4141	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	289583317
83	NC_013923	AAC	2	6	4142	4147	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	289583317
84	NC_013923	ACA	2	6	4158	4163	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	289583317
85	NC_013923	ACG	2	6	4179	4184	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289583317
86	NC_013923	CAA	2	6	4189	4194	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	289583317
87	NC_013923	CTA	2	6	4215	4220	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289583317
88	NC_013923	ACC	2	6	4302	4307	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	289583317
89	NC_013923	GCG	2	6	4374	4379	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289583317
90	NC_013923	CGAG	2	8	4417	4424	25 %	0 %	50 %	25 %	289583317
91	NC_013923	GAC	2	6	4462	4467	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289583317
92	NC_013923	GCGA	2	8	4489	4496	25 %	0 %	50 %	25 %	289583317
93	NC_013923	GCGT	2	8	4606	4613	0 %	25 %	50 %	25 %	289583317
94	NC_013923	GTACG	2	10	4707	4716	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
95	NC_013923	ATC	2	6	4775	4780	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_013923	AGT	2	6	4810	4815	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
97	NC_013923	TGTC	2	8	4837	4844	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
98	NC_013923	GCT	2	6	4876	4881	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_013923	GAC	2	6	4948	4953	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289583318
100	NC_013923	TCG	2	6	5043	5048	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289583318
101	NC_013923	AACG	2	8	5050	5057	50 %	0 %	25 %	25 %	289583318
102	NC_013923	TCG	2	6	5127	5132	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289583318
103	NC_013923	TGA	2	6	5143	5148	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289583318
104	NC_013923	CGA	2	6	5311	5316	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289583318
105	NC_013923	TGT	2	6	5317	5322	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	289583318
106	NC_013923	CCT	2	6	5371	5376	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	289583318
107	NC_013923	CGAC	2	8	5397	5404	25 %	0 %	25 %	50 %	289583318
108	NC_013923	GCC	3	9	5458	5466	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289583318
109	NC_013923	TCGA	2	8	5522	5529	25 %	25 %	25 %	25 %	289583318
110	NC_013923	CGG	2	6	5530	5535	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289583318
111	NC_013923	ATC	2	6	5540	5545	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289583318
112	NC_013923	ACG	2	6	5550	5555	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289583318
113	NC_013923	CGT	2	6	5658	5663	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289583318
114	NC_013923	CGA	2	6	5683	5688	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289583318
115	NC_013923	GTC	2	6	5769	5774	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289583318
116	NC_013923	CGG	2	6	5834	5839	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289583318
117	NC_013923	TCG	2	6	5875	5880	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289583319
118	NC_013923	GC	3	6	5893	5898	0 %	0 %	50 %	50 %	289583319
119	NC_013923	TCAC	2	8	5902	5909	25 %	25 %	0 %	50 %	289583319
120	NC_013923	CGTC	2	8	5993	6000	0 %	25 %	25 %	50 %	289583319
121	NC_013923	GTTC	2	8	6005	6012	0 %	50 %	25 %	25 %	289583319
122	NC_013923	TGC	2	6	6054	6059	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289583319
123	NC_013923	CCTG	2	8	6074	6081	0 %	25 %	25 %	50 %	289583319
124	NC_013923	CGT	2	6	6116	6121	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289583319
125	NC_013923	CGA	3	9	6122	6130	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289583319
126	NC_013923	CGA	2	6	6257	6262	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289583319
127	NC_013923	CGA	2	6	6347	6352	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289583319
128	NC_013923	CTCTTC	2	12	6506	6517	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
129	NC_013923	CTC	2	6	6593	6598	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
130	NC_013923	ACC	2	6	6614	6619	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	289583320
131	NC_013923	GCT	2	6	6658	6663	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289583320
132	NC_013923	CTG	2	6	6668	6673	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289583320
133	NC_013923	CTG	2	6	6686	6691	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289583320
134	NC_013923	TTCG	2	8	6772	6779	0 %	50 %	25 %	25 %	289583320
135	NC_013923	GTA	2	6	6786	6791	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289583320
136	NC_013923	TC	3	6	6802	6807	0 %	50 %	0 %	50 %	289583320
137	NC_013923	CGCAG	2	10	6814	6823	20 %	0 %	40 %	40 %	289583320
138	NC_013923	GTCG	2	8	6827	6834	0 %	25 %	50 %	25 %	289583320
139	NC_013923	GTGC	2	8	6848	6855	0 %	25 %	50 %	25 %	289583320
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141	NC_013923	TAG	2	6	6937	6942	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
142	NC_013923	GGT	2	6	6974	6979	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
143	NC_013923	GTT	2	6	6993	6998	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
144	NC_013923	TTG	2	6	7014	7019	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
145	NC_013923	CAGC	2	8	7076	7083	25 %	0 %	25 %	50 %	289583321
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151	NC_013923	GTTT	2	8	7332	7339	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
152	NC_013923	TAC	2	6	7411	7416	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289583322
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261	NC_013923	CGTG	2	8	12381	12388	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
262	NC_013923	CTC	2	6	12389	12394	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
263	NC_013923	TGACT	2	10	12477	12486	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
264	NC_013923	TGGT	2	8	12525	12532	0 %	50 %	50 %	0 %	289583329
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267	NC_013923	GGCGCA	2	12	12610	12621	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	289583329
268	NC_013923	CAC	2	6	12626	12631	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	289583329
269	NC_013923	AGA	2	6	12658	12663	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289583329
270	NC_013923	TTA	2	6	12702	12707	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	289583329
271	NC_013923	TGA	2	6	12784	12789	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289583329
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274	NC_013923	TGA	2	6	12946	12951	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289583329
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398	NC_013923	CGT	2	6	18483	18488	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289583334
399	NC_013923	TGA	2	6	18577	18582	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289583334
400	NC_013923	GGT	2	6	18663	18668	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	289583334
401	NC_013923	CGA	2	6	18701	18706	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289583334
402	NC_013923	TCT	2	6	18712	18717	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289583334
403	NC_013923	CGTG	2	8	18797	18804	0 %	25 %	50 %	25 %	289583334
404	NC_013923	GCA	2	6	18877	18882	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289583334
405	NC_013923	AGC	2	6	18949	18954	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
406	NC_013923	CTCTC	2	10	19001	19010	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
407	NC_013923	ATCG	2	8	19070	19077	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
408	NC_013923	TGCC	2	8	19112	19119	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
409	NC_013923	TCT	2	6	19142	19147	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
410	NC_013923	ACTTCT	2	12	19148	19159	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
411	NC_013923	CG	3	6	19178	19183	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
412	NC_013923	ACTC	2	8	19186	19193	25 %	25 %	0 %	50 %	289583335
413	NC_013923	CGT	2	6	19236	19241	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289583335
414	NC_013923	CGT	2	6	19244	19249	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289583335
415	NC_013923	TCGA	2	8	19252	19259	25 %	25 %	25 %	25 %	289583335
416	NC_013923	CGC	2	6	19262	19267	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289583335
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418	NC_013923	GCGG	2	8	19341	19348	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
419	NC_013923	GTA	2	6	19349	19354	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
420	NC_013923	TA	3	6	19378	19383	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
421	NC_013923	CCCA	2	8	19385	19392	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
422	NC_013923	CAT	2	6	19461	19466	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
423	NC_013923	ACT	2	6	19505	19510	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
424	NC_013923	CAC	2	6	19581	19586	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	289583336
425	NC_013923	GGC	2	6	19668	19673	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289583336
426	NC_013923	GAC	2	6	19695	19700	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289583336
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430	NC_013923	GAA	3	9	19944	19952	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289583336
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432	NC_013923	CGCT	2	8	19964	19971	0 %	25 %	25 %	50 %	289583336
433	NC_013923	AGGT	2	8	20002	20009	25 %	25 %	50 %	0 %	289583336
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437	NC_013923	TTC	2	6	20196	20201	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289583336
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439	NC_013923	CGA	2	6	20243	20248	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289583336
440	NC_013923	GAG	3	9	20262	20270	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	289583336
441	NC_013923	GCG	2	6	20314	20319	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289583336
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445	NC_013923	CGA	3	9	20496	20504	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289583336
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453	NC_013923	CGA	2	6	20747	20752	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289583336
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458	NC_013923	CGA	2	6	20985	20990	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
459	NC_013923	CGC	2	6	20996	21001	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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483	NC_013923	ACC	2	6	22234	22239	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
484	NC_013923	GTT	2	6	22270	22275	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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495	NC_013923	TCG	2	6	22564	22569	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289583338
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498	NC_013923	CCT	2	6	22751	22756	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	289583338
499	NC_013923	CGA	2	6	22802	22807	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289583338
500	NC_013923	CGT	3	9	22823	22831	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289583338

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